Подвижническая жизнь в Ростовском Богоявленском монастыре украсила преподобного Игнатия саном настоятеля той же обители. Она же в 1261 г. возвела его на архипастырскую ростовскую кафедру. Подвижнически жил он и в сане святительском, как показывали дела и кончина его. Князь Глеб Василькович, принявший в удел Белозерский край, тогда как старший брат его оставался ростовским князем, раз отправился по реке Позоровице на Кубенское озеро, чтобы потом по Сухоне достигнуть Устюга. На озере застигла его страшная буря с громом и молнией, и суда его были близки к тому, чтобы погибнуть в волнах. В момент опасности для жизни князь дал обет: если удастся спастись, на том месте, где пристанет первый корабль, построить храм. Суда прибило к Каменному острову. Здесь князю повстречались 23 пустынника. Они обращали в святую веру чудь и корелов, живших на северо-восточном берегу Кубенского озера. « Еще бо тогда не вси прияша святое крещение, но бе многое множество неверных человек вскрай Кубенского озера великого по брегом». Пустынники для молитвы собирались в бедной часовне, поскольку для церкви не было средств. Князь, помня свой обет, приказал построить для святых людей храм Преображения Господня и кельи. Потом он прислал для храма иконы и книги, а епископ Игнатий посвятил старца Федора в настоятели обители. Трудами подвижников и содействием святителя обитель быстро обрела благополучие. В 1269 г. в устье реки Шексны, на берегу Белого озера, была поставлена обитель Святой Троицы, первая в Белозерском краю. Она также оказала значительное содействие в распространении истинного учения чудью.
В 1269 г. юрьевский князь Дмитрий Святославич, больной и онемевший, принимал от святителя Игнатия пострижение в иночество. Едва закончился обряд, как князь-инок внятно проговорил: «Господь да воздаст тебе за труд твой, святой владыка! Ты приготовил меня в дальний путь воином Христовым. Иду к Нему с верой и надеждой».
В Ростове при святителе Игнатии доживала последнее десятилетие княгиня Мария, вдова князя-мученика Василька Ростовского и дочь князя-мученика Михаила Черниговского, которая, оставшись юной вдовой с малыми детьми, посвятила себя их воспитанию. Ею был основан Спасский монастырь, и в 1271 г. здесь же она была погребена. В 1274 г. святитель Игнатий присутствовал на знаменитом Владимирском соборе; в 1276 г. отпевал в Ростовском соборе князя Василия; в 1278 г. в том же соборе им был похоронен князь Глеб Василькович – усердный строитель храмов в Белозерском крае, выкупивший многих пленников из Орды и щедро помогавший бедным.
В 1280 г. святитель Игнатий во второй раз путешествовал в Орду для ходатайства за церковный причт; участвовал в отпевании тела почившего митрополита Кирилла; порыл оловом он и вымостил мрамором храм Богородицы в Ярославле. Блистательным подвигом его было примирение князей Дмитрия и Константина Борисовичей Ростовских. Отняв Белозерский удел у князя Михаила, они перессорились между собой и едва не дошли до кровопролития. Своими внушениями святитель добился того, что возвратили князю Михаилу Глебовичу его удел, а остальные земли поделил между собой. В память евангельского мира Игнатий заложил в Ростове храм Бориса и Глеба и в следующем году скончался.
Святитель Игнатий прославился нетлением и чудной целительной силой своих мощей еще до погребения. Чудеса начались уже во время отпевания. Когда несли тело, по тогдашнему обычаю, на одре в собор, две благочестивые инокини видели, святитель встал с одра, взошел на высоту по воздуху, как по лестнице, стал над собором, благословил народ и весь город, потом сошел к месту, где решили похоронить его тело. Тогда же исцелился архимандрит Стефан – его скорченный с рождения палец выпрямился, лишь только коснулся он святых мощей. На другой день, когда по совершении литургии и погребального пения положили тело с одра в гроб и подали список священников и дьяконов, посвященных Игнатием во время его святительства, усопший простер руку и взял свиток.
По летописи XV века святитель Игнатий – «великий чудотворец», в грамотах XVI века – «св. чудотворец».